Информация о ходе выполнения проекта Мероприятия 4.6.5. «Обеспечение реализации мероприятий Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий» (ведомственный проект «Проведение прикладных научных исследований по широкому спектру направлений») Минобрнауки России с ГНЦ ИБХ РАН по Соглашению № 075-15-2025-488 (внутренний номер 15.ИП.25.10) о предоставлении субсидии от 29 мая 2025 г. по теме: «Разработка генетических технологий для создания средств диагностики, профилактики и лечения онкологических заболеваний».
За отчетный период 1-го этапа (29.05.2025 – 31.12.2025) в рамках выполнения соглашения были проведены следующие работы:
- Создание лаборатории инструментов для персонализированной клеточной иммунотерапии.
- Анализ литературы и разработка биоинформатических подходов анализа имеющихся данных транскриптомов с целью выявления неоантигенов в результате изменений в сплайсинге и транслатомов с целью выявления изменений экспрессии на уровне биосинтеза белка.
- Сбор биообразцов пациентов с онкологическими заболеваниями. Разработка методики культивационно-независимого скрининга опухоль-специфичных клонов антител с использованием дрожжевого дисплея.
- Получение генетических конструкций, кодирующих адресные опухоль-специфичные токсины, и создание соответствующих штаммов-продуцентов.
- Дизайн панели генетических конструкций, кодирующих неоантигены и химерные антигенные рецепторы, нацеленные на эти неоантигены. Получение ленти- и ретровирусов, содержащих последовательности неоантигенов, для модификации опухолевых клеток и Т клеток человека и мыши. Создание панели опухолевых клеток-мишеней с помощью полученных вирусных векторов.
- Дизайн линкерных молекул, их комбинаций с флуорофорами и цитостатиками для последующего создания конъюгатов на основе моноклональных антител.
- Проведение анализа транскриптомных данных, характеризующих изменения в опухоли на фоне применения ингибиторов AXL рецептора.
- Анализ для оценки рисков, связанных с правовой охраной и использованием результатов исследований.
- Актуализация с учетом специфики проекта и чтение курсов по дополнительной профессиональной программе повышения квалификации «Гены, геном и генотерапевтические препараты» (72 академических часа) и дополнительной профессиональной программе повышения квалификации «Биоинженерия лекарственных препаратов на основе рекомбинантных белков и малых молекул» (72 академических часа).
- Организация и проведение ежегодной школы-конференции для студентов, аспирантов и молодых ученых «Современные генетические технологии для науки и медицины».
- Разработка плана семинарских занятий для школьников старших классов «Генетическая биоинженерия» для закрепления интереса у учащихся к научно-исследовательской работе и помощи с определением дальнейшего выбора научной деятельности.
- Организация стажировок молодых сотрудников членов-коллектива в ведущие образовательные и научные организации страны и/или в зарубежные научные центры.
В результате выполнения работ первого этапа работ по Соглашению № 075-15-2025-488 о предоставлении субсидии получены нижеследующие основные результаты:
- Разработаны положение, штатное расписание, планы работ для лаборатории инструментов для персонализированной клеточной иммунотерапии.
- Представлены список антигенов, уникальных для клеток глиобластомы; список антигенов, экспрессия генов которых может служить маркером возникновения устойчивости к определенному виду терапии; список антигенов, общих для устойчивых к терапии клеток глиобластом.
- Осуществлен сбор биообразцов пациентов с онкологическими заболеваниямиПредставлена методика суспензионного выделения опухоль-специфичных клонов антител. Получены реконструированные репертуары В-клеточных рецепторов в виде дрожжевых клеточных библиотек. Представлены условия прижизненной модификации опухолевых клеток и скрининга опухоль-специфичных клонов в суспензии с опухолевыми клетками.
- Созданы плазмиды, направляющие синтез адресных токсинов, и утверждены в виде документа «Паспорта генетических конструкций». Получены штаммы-продуценты адресных токсинов, которые утверждены в виде документа «Паспорта штаммов-продуцентов». Наработаны, выделены и очищены пробные партии токсинов в количестве не менее 5 мг каждого вида токсинов, которые утверждены Актом наработки партии токсинов.
- Создана панель генетических конструкций, кодирующих неоантигены и химерные антигенные рецепторы, нацеленные на эти неоантигены. Получены ленти- и ретровирусные векторы для модификации опухолевых клеток и Т клеток человека и мыши, которые утверждены в виде документа «Паспорта генетических конструкций». Определена панель опухолевых клеток-мишеней с помощью полученных лентивирусных векторов.
- Определена панель линкерных молекул и их комбинаций с флуорофорами и цитостатиками.
- Проведен анализ транскриптомных данных опухолевых клеток на фоне применения ингибиторов AXL рецептора. Работы выполнены за счет софинансирования из внебюджетных источников ГНЦ ИБХ РАН.
- Проведен патентный анализ, анализ технологических и бизнес-перспектив и для оценки рисков, связанных с правовой охраной и использованием результатов исследований. Работы выполнены за счет софинансирования из внебюджетных источников ГНЦ ИБХ РАН.
- Созданы актуализированные программы дополнительного профессионального повышения квалификации Биоинженерия лекарственных препаратов и Генотерапевтические препараты в ГНЦ ИБХ РАН, в очно-заочном формате (вечерние лекции), для 20 участников из Центрального, Северо-Западного и Сибирского федеральных округов России. Проведено чтение лекций с 10.11.2025 по 24.12.2025 г.
- В ГНЦ ИБХ РАН проведена школа-конференции для студентов, аспирантов и молодых ученых «Современные генетические технологии для науки и медицины».
- Проведена стажировка трех молодых сотрудников членов-коллектива и представлены отчеты в виде отдельных документов.
